连蒲双清胶囊的副作用是引发拉肚子。复方蒲芩胶囊和连蒲双清片属于清热解毒类药物清热解毒，燥湿止泻，用于肠炎和痢疾以及疖子，创伤性炎症和乳腺炎，胆囊炎等疾病。有些患者饭后会有腹泻的副作用，建议使用双歧杆菌活菌胶囊和蒙脱石粉来改善腹泻病，饮食仍然需要注意，以防止吃辛辣和油腻的食物。
连蒲双清片会导致胃肠道反应，有些患者会对此药过敏。连蒲双清片具有清热解毒、燥湿止痢的的功效，要在饭后服用，按医嘱服用，过量用药，可能引起胃部烧灼的感觉，还有可能会觉得嘴里发干严重，可能会出现过敏性麻疹，妊娠期、哺乳期的妇女也尽量不要用。建议患者在医生指导下服用，避免产生不良反应。
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